实验动物质量检测中心设在实验动物中心，依托本中心建有甘肃省实验动物质量检测实验室。主要由细胞培养室、细菌学检测实验室，病毒学检测实验室，寄生虫学检测实验室，遗传学检测实验室和环境生态学检测实验室组成。主要仪器设备有动植物遗传工作站、显微操作（注射）仪、自动微生物分析仪、自动生化分析仪、自动酶标仪、自动动物血液分析仪、自动电解质分析仪、自动尿分析仪、自动血凝分析仪、生物安全柜、PCR仪、CO2细胞培养箱、病理学和生态环境检测仪器设备等。

   实验动物质量检测中心已通过甘肃省技术质量监督局认证和国家实验动物质量检测中心技术评审。主要承担甘肃省及周边省市的实验动物质量检测的工作，包括实验动物的遗传学、细菌学、真菌学、病毒学、寄生虫学、病理学和生态环境学等项目。
   经过多年的建设和努力，动物质量检测中心已成为甘肃省重要的实验动物科技基地，并多次进行全省实验动物质量检测工作，为兄弟单位培训实验动物质量检测人员。