电子显微镜室始建于1979年，现有独立建筑面积330 m2，内设配电室、制样室、切片室、无菌室、示教室、3个主机室、真空喷镀室和暗室等，配有日本电子公司JEM－100cx和JEM-1230型透射电子显微镜各1台（配备GATAN多扫描数字化CCD相机），JSM－6380Lv扫描电子显微镜1台。同时配备超薄切片机、半薄切片机、真空干燥仪和离子溅射仪等用于透射电镜和扫描电镜制样的常规设备，能满足各类生物样品及材料样品检测的需要。
电镜室自成立以来，在超微结构的研究方面积累了丰富的经验，并开展了许多新的技术探索，承担了校内外生物样品及材料样品的超微结构检测分析工作，曾承担多项科研课题，并为医学本科生、硕士研究生开设《医学超微结构与电镜技术》课程，依托组织学专业培养了数届硕士研究生，为我校医学科学研究和教学工作做出了贡献。
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